Дії фільму відбуваються через двадцять років, після того як Корнеліусу і Зірі вдалося втекти з планети мавп. Страшна епідемія на Землі погубила всіх кішок і собак, після чого люди почали заводити мавп в якості домашніх вихованців. Виявивши у них здатність швидко навчатися, вони стали тренувати їх на виконання нескладної роботи по дому. До 1991 року Америка знову стає рабовласницькою країною, в якій використовується праця приматів. Незабаром в Лос-Анджелес приїжджає власник цирку Армандо, а разом з ним і Цезар, єдиний син мавп з майбутнього, якого всі вважали загиблим. Бачачи, що відбувається навколо, Цезар вирішує стати на захист родичів, з якими так несправедливо поводяться люди...