Проходить три роки з того часу, як десептикони на чолі з Мегатроном програли битву за галактичне панування. Охороняти Землю від нових атак залишилася невелика команда автоботів, якою керує Оптімус Прайм. У містечку Джаспер, штат Невада, підлітки Міко, Джек і Рафаель несподівано дізнаються про існування трансформерів і тепер змушені взяти участь у майбутній битві за рідну планету. Мегатрон, який повернувся на Землю, планує перемогти у війні за допомогою таємничої речовини під назвою «Темний Енергон», здатної воскресати загиблих роботів.