Японія. Дорогою додому Ханзо Хасаші, грандмайстер клану Ширай Рю, разом із юним сином Сатоші потрапляють у засідку. Декілька ніндзя з ворожого клану Лін Куей вбивають решту членів Ширай Рю, зокрема дружину Ханзо. Грандмайстер розправляється з усіма противниками, але Саб-Зіро, який несподівано прибув, вбиває Сатоші на очах батька, а потім і самого Ханзо. Через деякий час Хасаші воскресає в глибинах пекла. Він одержимий бажанням помститися Саб-Зіро і погоджується брати участь у турнірі Mortal Kombat на боці чаклуна Куан Чі. Ханзо бере собі ім'я Скорпіон і починає свій непростий шлях до перемоги та боротьби за справедливість.